Implémentation d'une nouvelle sonde de capture et de ligature

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Jul 21, 2023

Implémentation d'une nouvelle sonde de capture et de ligature

Malaria Journal volume 22, Numéro d'article : 21 (2023) Citer cet article 1375 Accès à 2 détails d'Altmetric Metrics Le dépistage et le traitement de masse (MSAT) pour l'élimination du paludisme ne disposent pas d'un diagnostic idéal

Malaria Journal volume 22, Numéro d'article : 21 (2023) Citer cet article

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Détails des métriques

Le dépistage et le traitement de masse (MSAT) pour l'élimination du paludisme ne disposent pas d'un outil de diagnostic idéal pour permettre des tests sensibles et abordables sur la population cible sur le terrain. Cette étude a évalué si la sonde-PCR de capture et de ligature (CLIP-PCR) pouvait être utilisée dans un MSAT de terrain à Laiza City, au Myanmar.

Au jour 0, deux gouttes de sang séché ont été prélevées sur chaque participant. Le premier jour, tous les échantillons ont été dépistés pour Plasmodium dans un laboratoire de 20 m2 équipé d'un établi, d'une enceinte de biosécurité, d'un réfrigérateur, d'un incubateur à agitation de paillasse et d'un appareil qPCR, par quatre techniciens utilisant CLIP-PCR avec regroupement d'échantillons, dans une clinique de santé de la ville frontalière chinoise de Nabang. Au jour 2, tous les positifs ont été suivis et traités.

Sur 15 038 personnes (65 % de la population totale) dépistées, 204 (1,36 %) étaient positives au CLIP-PCR. Parmi eux, 188, 14 et 2 étaient infectés par Plasmodium vivax, Plasmodium falciparum et P. vivax/P. falciparum, respectivement. La capacité de test était de 538 personnes/jour, pour un coût de 0,92 USD/personne. La proportion d'infections submicroscopiques était de 64,7 %. Toutes les personnes positives ont reçu un traitement dans les 72 heures suivant le prélèvement sanguin.

L’utilisation du CLIP-PCR dans le MSAT dans des contextes de faible transmission peut soutenir les efforts d’élimination du paludisme dans la région frontalière entre la Chine et le Myanmar.

Le dépistage et le traitement de masse (MSAT) du paludisme sont définis comme le test d'une population entière dans une vaste zone géographique, suivi du traitement uniquement des individus positifs, qu'ils présentent ou non des symptômes du paludisme. Une telle approche fournit des informations importantes sur l’épidémiologie du paludisme, qui peuvent être utiles pour d’autres efforts de confinement de la maladie [1], et sont plus susceptibles d’être acceptées par la population cible que l’administration massive de médicaments [2]. De plus, un traitement prophylactique de masse à la primaquine pour contrôler les épidémies de Plasmodium vivax pourrait être dangereux en raison d'un taux élevé de déficit en glucose-6-phosphate déshydrogénase (jusqu'à 14,8 %) dans la population du district cible [3]. Bien que la stratégie MSAT ait récemment fait l'objet d'une attention renouvelée dans le contexte de l'élimination du paludisme, l'Organisation mondiale de la santé (OMS) n'a pas recommandé la MSAT comme stratégie d'intervention pour interrompre la transmission du paludisme, car il manque un outil de diagnostic très sensible et à haut débit. qui est à la fois rentable et convivial à exploiter [2, 4].

Pour surmonter ce défi, un test moléculaire à haut débit sur une plate-forme de plaque de 96 puits appelé Capture and ligation sonde-PCR (CLIP-PCR) a été développé [5], permettant la détection directe de l'ARN du paludisme sans purification d'acide nucléique ni transcription inverse, avec une limite de détection de 0,01 parasite du paludisme/µL de sang ou d'environ 0,33 parasite/µL si l'on utilise des gouttes de sang séché (DBS) de 3 mm [5, 8]. Cela répond à la limite de détection cible recommandée par l'OMS (2 parasites/µL ou moins) pour le dépistage du paludisme par PCR dans les contextes de faible transmission [6], tout en rendant le dépistage du paludisme plus facile et moins coûteux que la microscopie et la PCR imbriquée standard [7, 8]. Dans cette méthode, les cibles d'ARNr 18 S dans les échantillons de sang sont libérées par lyse cellulaire et capturées par une série de sondes spécifiques à queue sur les puits d'une plaque de capture à 96 puits par hybridation sandwich. Après élimination des sondes supplémentaires et des impuretés, les sondes à queue liée sont ligaturées pour former des matrices simple brin pour une amplification et une détection ultérieures par qPCR [5]. Récemment, une version améliorée de CLIP-PCR, la CLIP-PCR multi-sections (mCLIP-PCR), a été développée, permettant l'identification du genre et de l'espèce de Plasmodium avec un temps d'analyse considérablement réduit [9].

La région spéciale II de Kachin (KSR2), une zone montagneuse pauvre située dans le nord du Myanmar, partage une frontière terrestre de 214,6 km avec le comté de Yingjiang de la province du Yunnan, en Chine. Depuis le conflit régional en KSR2 en 2012, un grand nombre de personnes déplacées à l'intérieur du pays ont immigré et se sont réinstallées le long de la frontière sino-birmane, ce qui constitue un risque pour les résultats des activités transfrontalières conjointes de prévention et de contrôle du paludisme entre la Chine (province du Yunnan) et le Myanmar. [10,11,12,13,14]. Dans le KSR2 du Myanmar, l'incidence du paludisme est passée de 2,1 % en 2012 à 5,1 % en 2016 [15]. En outre, une épidémie de P. vivax a été observée dans la ville de Laiza et ses environs en 2016 [16], où le nombre de cas de paludisme a fortement augmenté de 2,3 fois, passant de 940 en 2015 à 2080 en 2016 [16]. Le nombre de cas de paludisme importés du Myanmar vers le comté de Yingjiang a rapidement augmenté, passant de 35 en 2012 [17] à 185 en 2016 [16], mettant en péril l'objectif d'élimination du paludisme dans le comté de Yingjiang d'ici 2020 [18,19,20].